Lukas Fuxjäger befasst sich mit den Interaktionen der Bewohner von Korallenriffen und deren Lebensräumen im und rund um das Riff. Spezielles Augenmerk liegt dabei auf der Zussammensetzung der Korallengemeinschaft und deren Zustand im Roten Meer.
Weiters arbeitet er auch mit heimischen Süßwasserfischen und forscht an der Universität Wien zu den Auswirkungen von Renaturierungsmaßnahmen der Ufer an der Donau und am Wienfluss. Dabei kommen verschiedenste Methoden und Arbeitsweisen, unter anderem auch Tauchen, zum Einsatz, um Einblicke und Daten für die Forschung zu erhalten.
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